Prowadzone rejestry i archiwa:

•     ewidencja podatników (osób fizycznych, przedsiębiorców i osób prawnych) w systemie komputerowym,
•     rejestr zastawów skarbowych
•     biblioteka akt podatkowych,
•     archiwum zakładowe/składnica akt Izby Skarbowej w Krakowie.

Zasady prowadzenia przez urzędy skarbowe rejestrów, ewidencji i archiwum regulują poniższe przepisy:

• Regulamin Organizacyjny Urzędu Skarbowego Kraków-Prądnik,
• Zarządzenie nr 14 Ministra Finansów z dnia 27 listopada 2001 r. w sprawie obsługi kancelaryjnej izb i urzędów skarbowych oraz organizacji i zakresu działania archiwów zakładowych i składnic akt (załącznik nr 1: instrukcja w sprawie obsługi kancelaryjnej izb i urzędów skarbowych; załącznik nr 3: instrukcja w sprawie organizacji i zakresu działania archiwów zakładowych w izbach skarbowych i składnic akt w urzędach skarbowych).
• Zarządzenie nr 1 Ministra Finansów z dnia 7 stycznia 2015r. w sprawie wprowadzenia jednolitego rzeczowego wykazu akt w izbach skarbowych i urzędach skarbowych (Dz.Urz z 2015r. poz.4 ze zm.)